Jean-Philippe Arrou-Vignod est né à Bordeaux en 1958. Il vit une partie de son enfance à Cherbourg, avec ses cinq frères – les fameux ``six Jean-quelque-chose`` de L'Omelette au sucre, dont il est le deuxième –, Toulon et Antibes, avant de se fixer en région parisienne.
Élève de l'École normale supérieure, il passe une agrégation de Lettres modernes, sans véritable vocation, tout simplement parce qu'il aime la littérature. Sa première rentrée scolaire en tant qu’enseignant, en 1984, correspond aussi à sa première rentrée littéraire puisque paraît son premier roman pour adultes, Le Rideau sur la nuit, récompensé par le prix du Premier Roman.
Cinq ans plus tard sort son premier roman pour la jeunesse : Le Professeur a disparu, qui débute la série des enquêtes de P.P. Cul-Vert.
En 2006, il crée avec Olivier Tallec les personnages de la série Rita et Machin aux éditions Gallimard Jeunesse.

Lorsqu'il écrit pour les enfants, Jean-Philippe Arrou-Vignod se fie à ses souvenirs, avec le souci constant d'offrir à ses lecteurs des livres qu'il aurait aimé lire à leur âge. Il a publié, entre autres :

L'Omelette au sucre
Le Camembert volant
La Soupe de poissons rouges

Jean-Philippe Arrou-Vignod est aujourd'hui directeur de collection chez Gallimard Jeunesse.